Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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NCOA1Q15788 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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NCOA1Q15788 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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NCOA1Q15788 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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NCOA1Q15788 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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NCOA1Q15788 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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