Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms