Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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UBE3CQ15386 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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UBE3CQ15386 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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UBE3CQ15386 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE3CQ15386 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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