Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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