Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH18Q13634 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms