Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNW1Q13573 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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