Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CAMK2BQ13554 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 WBP1LP6-201ENST00000438434 424 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 OR5AR1-201ENST00000624596 1026 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAMK2BQ13554 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms