Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BFSP2Q13515 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BFSP2Q13515 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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