Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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TCIRG1Q13488 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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