Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
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