Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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