Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SKP2Q13309 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms