Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO2Q13137 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms