Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRDM2Q13029 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
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