Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms