Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LMAN2Q12907 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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