Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
STX4Q12846 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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STX4Q12846 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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STX4Q12846 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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STX4Q12846 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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STX4Q12846 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
STX4Q12846 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
STX4Q12846 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
STX4Q12846 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
STX4Q12846 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
STX4Q12846 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
STX4Q12846 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
STX4Q12846 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
STX4Q12846 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
STX4Q12846 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
STX4Q12846 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
STX4Q12846 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
STX4Q12846 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
STX4Q12846 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
STX4Q12846 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
STX4Q12846 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
STX4Q12846 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
STX4Q12846 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
STX4Q12846 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
STX4Q12846 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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