Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TROQ12816 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TROQ12816 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TROQ12816 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TROQ12816 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TROQ12816 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TROQ12816 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TROQ12816 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TROQ12816 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TROQ12816 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TROQ12816 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TROQ12816 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TROQ12816 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TROQ12816 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TROQ12816 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TROQ12816 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TROQ12816 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TROQ12816 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TROQ12816 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TROQ12816 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TROQ12816 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TROQ12816 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TROQ12816 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TROQ12816 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TROQ12816 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TROQ12816 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TROQ12816 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TROQ12816 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TROQ12816 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TROQ12816 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TROQ12816 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TROQ12816 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TROQ12816 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms