Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms