Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IFFO1Q0D2I5 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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