Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms