Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNEQ04844 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms