Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF8Q02556 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms