Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRX1P78414 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IRX1P78414 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
IRX1P78414 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRX1P78414 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRX1P78414 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRX1P78414 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRX1P78414 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRX1P78414 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRX1P78414 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IRX1P78414 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRX1P78414 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms