Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PXNP49023 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PXNP49023 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms