Protein–RNA interactions for Protein: P48594

SERPINB4, Serpin B4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB4P48594 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SERPINB4P48594 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms