Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP13P45452 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP13P45452 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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MMP13P45452 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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MMP13P45452 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MMP13P45452 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MMP13P45452 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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