Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGIRP43119 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms