Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PIK3CBP42338 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms