Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBL1P28749 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBL1P28749 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RBL1P28749 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms