Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT1P26358 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNMT1P26358 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms