Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2AP24928 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms