Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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PRKCHP24723 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKCHP24723 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms