Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP5F1P24539 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5F1P24539 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms