Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FGFR3P22607 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FGFR3P22607 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms