Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms