Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
IFITM1P13164 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms