Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CLDN11O75508 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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CLDN11O75508 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CLDN11O75508 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CLDN11O75508 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CLDN11O75508 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLDN11O75508 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLDN11O75508 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLDN11O75508 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLDN11O75508 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLDN11O75508 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLDN11O75508 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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CLDN11O75508 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN11O75508 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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