Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPFIA3O75145 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms