Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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PDE6DO43924 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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PDE6DO43924 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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PDE6DO43924 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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PDE6DO43924 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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PDE6DO43924 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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PDE6DO43924 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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