Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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KDELR3O43731 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDELR3O43731 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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