Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHF1O43189 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHF1O43189 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHF1O43189 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PHF1O43189 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PHF1O43189 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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