Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIEO00221 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFKBIEO00221 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms