Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CROCC2H7BZ55 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CROCC2H7BZ55 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms