Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGB1P1B2RPK0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms