Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
C9orf92A6NGG3 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms