Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms