Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC162PA2VCL2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms