Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAD54BQ9Y620 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms