Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CCL27Q9Y4X3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CCL27Q9Y4X3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CCL27Q9Y4X3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CCL27Q9Y4X3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CCL27Q9Y4X3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CCL27Q9Y4X3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CCL27Q9Y4X3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CCL27Q9Y4X3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CCL27Q9Y4X3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CCL27Q9Y4X3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL27Q9Y4X3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL27Q9Y4X3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL27Q9Y4X3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL27Q9Y4X3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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